刘欢
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：渤海大学数理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金辽宁省“百千万人才工程”资助项目更多>>
- 相关领域：生物学理学更多>>
- DNA序列非退化的二维图形表示及其应用被引量：1
- 2014年
- 提出了一种新的DNA序列的2-D图形表示方法,并证明了它的非退化性,随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标.在此基础上,结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度,将DNA序列转化为一个29维的数值向量.对23个物种的β球蛋白基因和18个物种的线粒体NADH脱氢酶序列进行的系统发生分析,证明了所提方法的有效性.
- 李春刘欢褚威威费文超韩苗苗
- 关键词：DNA非退化系统发生分析
- 基于拟氨基酸多重集的DNA序列的数值刻画及其应用
- 2015年
- 利用密码子与氨基酸及终止信号之间的映射关系,提出了DNA序列的拟氨基酸序列。然后,借助多重集,构造了DNA序列的21维的数值向量表示,据此可计算DNA序列之间的相似距离。通过对汉坦病毒S片段全基因序列、番茄黄化曲叶病毒全基因组序列以及人鼻病毒全基因组序列3个数据集的系统发育分析,证明了所提方法的有效性。
- 李春褚威威刘欢费文超韩苗苗
- 关键词：DNA系统发育分析
- 凋亡蛋白亚细胞定位预测的新方法
- 2015年
- 基于频率位置信息与频率本身相结合的思想,并结合氨基酸的分类模型、理化性质和替换矩阵构造了蛋白质序列的特征向量;以最近邻方法作为分类器,利用ZW225和CL317两个经典数据集对该方法进行了检验,所得结果同其他亚细胞定位预测方法做了比较。结果表明该方法是有效的。
- 王爱华杨闫刘欢褚威威于晓庆李春
- 关键词：凋亡蛋白亚细胞定位氨基酸最近邻方法
