韩苗苗
- 作品数:2 被引量:1H指数:1
- 供职机构:渤海大学数理学院更多>>
- 发文基金:辽宁省“百千万人才工程”资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 基于拟氨基酸多重集的DNA序列的数值刻画及其应用
- 2015年
- 利用密码子与氨基酸及终止信号之间的映射关系,提出了DNA序列的拟氨基酸序列。然后,借助多重集,构造了DNA序列的21维的数值向量表示,据此可计算DNA序列之间的相似距离。通过对汉坦病毒S片段全基因序列、番茄黄化曲叶病毒全基因组序列以及人鼻病毒全基因组序列3个数据集的系统发育分析,证明了所提方法的有效性。
- 李春褚威威刘欢费文超韩苗苗
- 关键词:DNA系统发育分析
- DNA序列非退化的二维图形表示及其应用被引量:1
- 2014年
- 提出了一种新的DNA序列的2-D图形表示方法,并证明了它的非退化性,随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标.在此基础上,结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度,将DNA序列转化为一个29维的数值向量.对23个物种的β球蛋白基因和18个物种的线粒体NADH脱氢酶序列进行的系统发生分析,证明了所提方法的有效性.
- 李春刘欢褚威威费文超韩苗苗
- 关键词:DNA非退化系统发生分析