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黄银芝

作品数:3 被引量:14H指数:3
供职机构:浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室更多>>
发文基金:浙江省自然科学基金浙江省森林培育重中之重学科开放基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇山核桃
  • 3篇林学
  • 3篇经济林
  • 3篇经济林学
  • 3篇核桃
  • 2篇代谢
  • 2篇脂肪
  • 2篇脂肪代谢
  • 2篇CDNA文库
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白分析
  • 1篇序列标签
  • 1篇SSR
  • 1篇SSR标记
  • 1篇EST
  • 1篇EST序列
  • 1篇表达序列标签
  • 1篇SMART

机构

  • 3篇浙江农林大学
  • 1篇金华市农业科...

作者

  • 3篇曾燕如
  • 3篇黄有军
  • 3篇黄银芝
  • 1篇董雷鸣
  • 1篇夏国华
  • 1篇周秦
  • 1篇宋双

传媒

  • 3篇浙江农林大学...

年份

  • 1篇2015
  • 1篇2012
  • 1篇2011
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析被引量:3
2015年
山核桃Carya cathayensis为重要的油料干果树种,其非同一般的高含油率必定有其特殊的成油机制。为探索其成油机制,在已构建的山核桃脂肪代谢相关c DNA文库基础上,对c DNA进行随机克隆测序,对序列进行拼接、功能注释,基因本体论(gene ontology,GO)分类及基于拟南芥Arabidopsis thaliana的Fun Cat分类,并对与脂肪代谢相关的全长c DNA序列进行蛋白性质分析。结果共得到1 010条山核桃表达序列标签(ESTs),经拼接获得188个编码蛋白质的基因(unigene),其中92个contigs和96个singlets。GO分类将这些unigene分成细胞组分、分子功能和生物过程等3类,并发现各序列编码的基因并不承担单一的功能,有些序列在功能上有重叠;同时参照拟南芥的基因功能分类,将unigene序列在功能上分成9类,得到了143个全长c DNA序列,其中包括14个与脂肪代谢相关的c DNA序列。对12个与脂肪代谢相关的全长c DNA序列进行蛋白性质分析,发现它们均具有磷酸化位点;除油质蛋白外都没有跨膜区域,且不具信号肽结构,为非分泌蛋白,属于某个蛋白家族;不同的油体蛋白具有不同的跨膜区,且均具有信号肽结构,属于Oleosin super family蛋白家族。
黄银芝曾燕如周秦夏国华黄有军
关键词:经济林学山核桃表达序列标签脂肪代谢蛋白分析
山核桃SSR标记的初步开发被引量:6
2012年
基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物;建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验。结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8%。将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点。结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的。
宋双黄银芝董雷鸣黄有军曾燕如吴智敏
关键词:经济林学山核桃CDNA文库
山核桃脂肪代谢相关cDNA文库的构建被引量:6
2011年
山核桃Carya cathayensis种仁含油量较高,油质多为不饱和脂肪酸。在差异显示反转录-聚合酶链式反应(DDRT-PCR)方法研究山核桃果实成熟时期基因差异表达的基础上,采用SMART(switching mechanism at 5’end of RNAtranscript)技术构建了山核桃脂肪代谢时期的互补脱氧核糖核酸(cDNA)文库。未扩增文库的滴度为5.0×105个噬菌斑形成单位(pfu).mL-1,插入片段大小为0.7~2.5 kb,70.0%的片段超过1.0 kb;扩增文库的滴度为5.0×109pfu.mL-1,cDNA片段大小均在500 bp以上,重组率达94.5%,66.0%的片段超过1.0 kb。文库的构建为研究山核桃脂肪代谢机制、调控网络及相关基因的发现提供了条件。
黄银芝周秦黄有军曾燕如
关键词:经济林学山核桃CDNA文库SMART脂肪代谢
共1页<1>
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